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基于SNP标记的黄瓜遗传多样性分析
作者: 姚丹青 [1] 楼坚锋 [1] 朱文莹 [2] 张微微 [3] 夏建明 [1]
关键词: 黄瓜 遗传多样性 SNP标记 高分辨率溶解曲线 焦磷酸测序
摘要：通过查询NCBI、葫芦科基因组网站数据库获得42个黄瓜候选SNP位点.应用高分辨率溶解曲线技术对71个市售黄瓜品种进行SNP位点筛选,并通过焦磷酸测序进行SNP基因分型分析,探索SNP标记在黄瓜品种鉴定中的应用前景.结果表明:42个SNP位点中有30个位点的多态信息量为0.027-0.528,平均为0.247;71个黄瓜品种两两间的遗传相似系数分布在0.4032-0.9839,即30个SNP位点的基因分型数据信息可以将71份黄瓜品种区分开.
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