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猪流行性腹泻病毒荧光定量PCR检测方法的建立及应用
作者: 董世娟 [1,2] ; 石明明 [1,2] ; 朱于敏 [1,2] ; 于瑞嵩 [1,2] ; 张源淑 [3] ; 夏东 [1] ; 李震 [1,2]
关键词: 猪流行性腹泻病毒 荧光定量PCR M基因 TaqMan
摘要:利用DNASta软软件对GeneBank中登录的猪流行性腹泻病毒(PEDV)M基因序列进行分析,选择保守区域设计合成引物和探针,制备M基因重组质粒标准品,建立检测PEDV的TaqMan荧光定量PCR方法,并验证其敏感性、特异性及重复性。结果表明:建立的定量标准曲线Ct值和模板起始拷贝数对数在10~8—10~1copies/μL有良好的线性关系,相关系数R~2为0.997,该方法可检测到初始模板中6.368 copies/μL的质粒DNA;应用该方法检测49份临床样品,阳性率达98%,比普通RT-PCR方法检测的阳性率高18%。研究表明,建立的PEDV TaqMan荧光定量PCR检测方法具有较好的灵敏性、特异性和重复性,适用于临床样本中PEDV的快速检测,为PEDV的感染和增殖规律的研究奠定了基础。
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