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猪流行性腹泻病毒检测与 S 蛋白中和抗原表位基因分析
作者: 丁卫星 [1] 王荣谈 [1] 郭佳宏 [2] 廖学文 [2] 缪德年 [2]
关键词: 猪流行性腹泻病毒 S 蛋白 进化树
摘要:应用 RT-PCR 对2015年江苏、安徽、山东9个猪场的腹泻样品(新鲜粪便、肠道组织等)进行 PEDV和 TGV 检测,并对检测到的一株 PEDV(CHNJPK2015)的纤突蛋白中和抗原表位基因进行克隆测序和遗传进化分析。结果表明:9个猪场 PEDV 检测阳性率为100%,PEDV 个体阳性率为63.89%,TGEV 均未检出,说明本次流行的仔猪腹泻病主要是由 PEDV 感染引起的。所测毒株与参考毒株可分为3个群,CHNJPK2015株与AVCT12、Br1?87、CHM2013、LZC、SM98等毒株的 S 蛋白中和抗原表位基因的遗传距离较近,核苷酸序列同源性达99.5%—99.8%,处于同一群;而与2014年中国各地分离的 CH?GDZQ?2014、FJ-FQ 2014、FJ-ZP 2014、PEDV-LY、PEDV-WS、PZ1406、SC1402、SH1404和疫苗株 CV777序列的遗传距离较远,核苷酸序列同源性为92.9%—96.2%,处于不同的群。
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